HE染色法又称苏木精 - 伊红染色法，是一种广泛用于临床和实验中的染色方法。顾名思义，HE染色就是以苏木精染液和伊红染液先后将特定的细胞成分上色，表现出一定的嗜酸性或嗜碱性。

蓝色的苏木精染液为碱性，主要使细胞核内的染色质与胞质内的核酸着紫蓝色。细胞内的酸性物质如细胞核的染色质、腺细胞和神经细胞内的粗面内质网及透明软骨基质等均可被碱性染料染色，这些物质具有嗜碱性。例如，脱氧核糖核酸(DNA)两条链上的磷酸基向外，带负电荷，呈酸性，很容易与带正电荷的苏木精碱性染料以离子键结合而被染色。

伊红为酸性染料，主要使细胞质和细胞外基质中的成分着红色。它的染色对象有细胞质中的蛋白质如红细胞中的血红蛋白、嗜酸粒细胞的颗粒及胶原纤维和肌纤维等等，这些物质具有嗜酸型。伊红的染色原理也类似苏木精，伊红是一种化学合成的酸性染料，在水中离解成带负电荷的阴离子，与蛋白质的氨基正电荷的阳离子结合使胞浆染色。所以细胞浆、红细胞、肌肉、结缔组织、嗜伊红颗粒等被染成不同程度的红色或粉红色。

必须注意的是，我们在制作HE切片的过程中，染色前要用二甲苯将切片组织中的蜡彻底脱净，染色后用酒精将切片组织彻底脱水透明，再用二甲苯提高组织的透光度，最后用中性树胶封盖。如果脱蜡脱水不彻底，封片后呈白色雾状，镜下观察模糊不清，且容易褪色。

通过HE的染色，各种组织或细胞成分与病变的一般形态结构特点均可显示出来。方便我们观察细胞内部的形态结构。细胞核着蓝紫色，我们可以分辨是否有异常的核分裂象；观察细胞质的染色，我们可以了解胞质中不同成分的不同比例。

上图示：在脂肪变性的肝细胞中，细胞浆中出现大一不一的脂滴，脂肪变性更加明显，纤维间隔增厚，汇管区的胶原纤维增生包绕周围细胞，我们可以看到细胞坏死。这些都对我们病理诊断大有帮助。